Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAF2Q96CS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAF2Q96CS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms