Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TM4SF18Q96CE8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms