Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAVIN3Q969G5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAVIN3Q969G5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms