Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR2Q969E8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms