Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBXN4Q92575 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN4Q92575 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms