Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4DQ8WXI8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4DQ8WXI8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4DQ8WXI8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4DQ8WXI8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLEC4DQ8WXI8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLEC4DQ8WXI8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms