Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC197Q8NCU1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms