Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms