Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms