Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms