Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms