Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNMB4Q86W47 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMB4Q86W47 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms