Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG4DQ86TL0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms