Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT28Q7Z3Y7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms