Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APTXQ7Z2E3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms