Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY3Q7L099 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms