Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMUB2Q71RG4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms