Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
C3orf33Q6P1S2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C3orf33Q6P1S2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms