Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRC8EQ6NSJ5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRC8EQ6NSJ5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms