Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TYW3Q6IPR3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TYW3Q6IPR3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms