Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF123Q5XPI4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF123Q5XPI4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms