Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ECM29Q5VYK3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms