Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms