Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms