Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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