Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COLEC12Q5KU26 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COLEC12Q5KU26 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms