Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms