Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN2Q52LD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN2Q52LD8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms