Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SP6Q3SY56 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SP6Q3SY56 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms