Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF3Q3KNV8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms