Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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