Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IMPG1Q17R60 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IMPG1Q17R60 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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