Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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