Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACKR1Q16570 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACKR1Q16570 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms