Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CNGA3Q16281 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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CNGA3Q16281 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNGA3Q16281 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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