Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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E2F4Q16254 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F4Q16254 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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