Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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VAMP3Q15836 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP3Q15836 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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