Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUM3Q15397 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PUM3Q15397 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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