Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTF1Q15361 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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