Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCAPHQ15003 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCAPHQ15003 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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