Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLCA4Q14CN2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLCA4Q14CN2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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