Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL9A2Q14055 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL9A2Q14055 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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