Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX2Q13950 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX2Q13950 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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