Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL1Q13616 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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