Protein–RNA interactions for Protein: Q13561

DCTN2, Dynactin subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN2Q13561 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCTN2Q13561 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN2Q13561 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms