Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LSAMPQ13449 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LSAMPQ13449 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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