Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms