Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CBX3Q13185 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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