Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRDNQ13061 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRDNQ13061 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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