Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BPTFQ12830 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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